MRIは脳や柔らかい組織の検査に適しています。骨や空気の影響を受けにくく、レントゲンやCTでは良く見えない骨の中も見ることができます。それは体の中の水素原子の分布を見ているからです。

人間の体はほとんどが水でできています。性別や年齢で差はありますが、成人では体重の約60～65パーセントを水が占めています。水に含まれる水素原子は強い磁場に反応する性質を持っており、この性質を利用して、人体のあらゆる方角の断面を撮影するのがMRI検査です。
例えばやわらかいゲル状の組織である椎間板は、レントゲンではX線が透過してしまい画像になりませんが、MRIは組織内の水分を利用しているので椎間板でも画像化することができます。CT検査と比較して、特に脳や脳血管、脊椎・脊髄の病巣に関しては、圧倒的な検査能力を持っています。血管撮影に関しては造影剤を利用しなくても血管像を見ることができるなどの特長があります（疾患や検査部位によっては、より正確な診断を行うために造影剤が必要となることがあります）。

ベッドで横になっているだけで、体の向きを変える必要もなく、検査による苦痛はありません。また強い磁力を使った検査であり放射線は使いませんので、放射線被爆の心配なく検査をお受けいただけます。